More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1545 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.6 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.5 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.15 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.64 
 
 		 206 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.68 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.13 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.65 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.74 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.9 
 
 		 201 aa  167  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  42.29 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  45.26 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.5 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.97 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  43.62 
 
 		 201 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  43.94 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  40.51 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.63 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.58 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.15 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.24 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.15 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  44.21 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.33 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  42.63 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  33.67 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  33.67 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.37 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  35.14 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  35.56 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  33.67 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  36.52 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  38.32 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.02 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  33.5 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  32.46 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  37.72 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  35.36 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  37.13 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  32.81 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  38.32 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  32.79 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  34.81 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  34.44 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  34.44 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  34.27 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.89 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  33.89 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  34.44 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  36.53 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  33.52 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  38.32 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  35 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1306  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  29.53 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  35.03 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  37.13 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  35.03 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  35.5 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  35 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  36.32 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  34.46 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4709  isopropylmalate isomerase small subunit  39.9 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5901  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  29.41 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  33.86 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  38.55 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  35.33 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  37.72 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  32.78 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  38.55 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2356  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.68 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  38.55 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  38.55 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  31.82 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  34.78 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  34.78 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  32.46 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3673  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  29.47 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.7 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  31.53 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  31.22 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1173  isopropylmalate isomerase small subunit  35.23 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2847  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.91 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  37.13 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  33.52 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  31.22 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  31.22 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.14 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  31.94 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  33.15 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  37.13 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  32.95 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  30.69 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0853  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.67 
 
 		 161 aa  92.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>