More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0590 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  51.37 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  55.04 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
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NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  47.68 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
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NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  41.96 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  43.36 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
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NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  43.7 
 
 		 264 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  47.66 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 227 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
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NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
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NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
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NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  44.95 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
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NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  42.99 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
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NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
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NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
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NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  57.58 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
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NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  45.19 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  49.07 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
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NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
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NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.97 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  53.03 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 216 aa  67  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  47.62 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  37.91 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  50.82 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  38.38 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  43.84 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
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NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
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NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
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