75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0127 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0127  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0384146  hitchhiker  0.00530729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1171  hypothetical protein  72.49 
 
 		 269 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.51603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0135  hypothetical protein  69.4 
 
 		 269 aa  396  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0102  hypothetical protein  68.66 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000654219 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0757  periplasmic binding protein  47.58 
 
 		 273 aa  234  8e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1584  periplasmic binding protein  32.77 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.409039  normal  0.308354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1104  periplasmic binding protein  22.89 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2460  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2762  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.599111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  35.77 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 379 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2169  periplasmic binding protein  34.96 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000287241  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  28.82 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2093  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  34.78 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.839257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  31.25 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3803  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  25.15 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.656087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0648  hemin-binding periplasmic protein  25.15 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3891  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  32.79 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1739  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.102964  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2226  periplasmic binding protein  33.94 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.41 
 
 		 356 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.45 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  29.41 
 
 		 517 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.79 
 
 		 305 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  29.84 
 
 		 296 aa  45.4  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  23.16 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  39.06 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  27.86 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  27.86 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  37.18 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  38.57 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  27.86 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  39.06 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  29.24 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  24.29 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  23.16 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  29.31 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1393  periplasmic binding protein  29.92 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310826  normal  0.0475326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.31 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  41.94 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2167  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579619  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  41.27 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  36.51 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  22.61 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  22.61 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  24.17 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0469  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  30.83 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.66 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  23.73 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4172  periplasmic binding protein  36.23 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0319081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  30.56 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.17 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  38.1 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 354 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.39 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  22.61 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 323 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  39.71 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.89 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  24.35 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  39.06 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  0.000000000756756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  37.5 
 
 		 299 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  38.1 
 
 		 303 aa  42  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>