More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1141 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  100 
 
 
308 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  69.68 
 
 
313 aa  409  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  61.22 
 
 
314 aa  362  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  61.22 
 
 
314 aa  362  4e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  51.44 
 
 
316 aa  323  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  37.06 
 
 
317 aa  218  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  41.42 
 
 
312 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  41.03 
 
 
315 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  36.36 
 
 
320 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  43.37 
 
 
312 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  37.89 
 
 
347 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  38.91 
 
 
321 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.88 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  35.85 
 
 
323 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.16 
 
 
321 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  34.22 
 
 
313 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  40.06 
 
 
316 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  34.5 
 
 
322 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  34.63 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  38.31 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  36 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  35.92 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  35.92 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  38.44 
 
 
322 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  38.06 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  36.81 
 
 
317 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  37.85 
 
 
323 aa  179  7e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.65 
 
 
302 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.68 
 
 
311 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.37 
 
 
352 aa  175  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  33.77 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  35.08 
 
 
297 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  35.08 
 
 
297 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  37.74 
 
 
317 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.87 
 
 
300 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  35.16 
 
 
312 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  37.66 
 
 
340 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.85 
 
 
298 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  36.54 
 
 
313 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  36.48 
 
 
321 aa  169  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  34.22 
 
 
313 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  34.08 
 
 
332 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  34.91 
 
 
327 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  33.23 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  38.17 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  35.71 
 
 
317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  32.8 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.87 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  36.04 
 
 
313 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  36.39 
 
 
332 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.19 
 
 
342 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.92 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  35.67 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  35.67 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  35.67 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  35.67 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  35.67 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  35.67 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  35.67 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  35.35 
 
 
327 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  35.35 
 
 
327 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  34.17 
 
 
323 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  35.35 
 
 
327 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  37.34 
 
 
323 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  35.96 
 
 
314 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  33 
 
 
297 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  38.29 
 
 
319 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.53 
 
 
315 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  33.76 
 
 
395 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  34.67 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.49 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  32.57 
 
 
302 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.13 
 
 
302 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  32.98 
 
 
313 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  31.82 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  32.7 
 
 
321 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  33.33 
 
 
336 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  33.23 
 
 
321 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  35.92 
 
 
335 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  30.84 
 
 
405 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.17 
 
 
303 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  31.03 
 
 
316 aa  149  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  34.52 
 
 
314 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  31.43 
 
 
316 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  34.5 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  33.88 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  32.14 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  35.6 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.09 
 
 
422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  31.21 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.15 
 
 
418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.12 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  32.1 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.44 
 
 
319 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  30 
 
 
322 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  34.53 
 
 
336 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.94 
 
 
408 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  33.97 
 
 
314 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  36.91 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.5 
 
 
335 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>