More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1783 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4594  ABC transporter related protein  67.57 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23020  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  61.29 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0484452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  46.95 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  48.81 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  42.02 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.02 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  46.36 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  47.43 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  47.43 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  45.82 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  44.62 
 
 		 259 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  47.43 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  45.56 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  46.15 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  44.22 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.6 
 
 		 271 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  45.74 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  46.67 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  43.97 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  44.74 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  44.96 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  44.22 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  46.61 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  44.02 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  43.43 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  45.1 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  44.98 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.78 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  46.06 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  43.97 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  43.97 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  44.79 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  40.66 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  41.3 
 
 		 307 aa  214  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  41.18 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  42.8 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  40.66 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  42.97 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  44.71 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  42.97 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  44.18 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  44.36 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  43.92 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2110  ABC transporter related  43.82 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  44.76 
 
 		 258 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  41.03 
 
 		 302 aa  211  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  41.04 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  42 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  41.83 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  40.38 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  40.15 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.82 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  46.25 
 
 		 336 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  43.31 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  45.38 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  42.8 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  44.31 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  42.97 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  43.55 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  44.81 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  45.16 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  45.38 
 
 		 593 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2117  ABC transporter related  45.16 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  44.27 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.97 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  44.62 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.27 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.37 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  43.08 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  44.18 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  44.14 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  43.82 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  43.82 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  43.82 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  43.97 
 
 		 612 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  40.49 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>