260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2528 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  75.95 
 
 		 237 aa  363  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  73.73 
 
 		 236 aa  358  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  73.73 
 
 		 236 aa  358  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  72.57 
 
 		 237 aa  351  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  72.57 
 
 		 237 aa  351  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  70.04 
 
 		 237 aa  345  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  70.31 
 
 		 241 aa  335  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  58.62 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  56.47 
 
 		 239 aa  261  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  57.94 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  54.55 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  54.91 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  55.7 
 
 		 231 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  54.46 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  54.82 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  54.82 
 
 		 231 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  55.36 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  50.92 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  52.91 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  48.61 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  48.36 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  49.78 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  45.41 
 
 		 287 aa  192  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  48.84 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  50.7 
 
 		 239 aa  191  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  50.7 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  49.77 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  44.29 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  44.04 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  45.33 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  46.88 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  43.42 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  45.41 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  44.12 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  48.94 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  48.15 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  43.85 
 
 		 262 aa  178  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  51.15 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  44.24 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  43.72 
 
 		 232 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  41.56 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  43.93 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  40.33 
 
 		 250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  47.11 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  46.67 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  42.72 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  43.26 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  46.22 
 
 		 220 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  42.06 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  44.39 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  47.44 
 
 		 221 aa  168  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  41.99 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  46.02 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  47.95 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  44.65 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  43.17 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  47.47 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0955  ribose-5-phosphate isomerase A  46.19 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  47.22 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002480  ribose 5-phosphate isomerase A  45.95 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00368346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  47.95 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  47.95 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  47.95 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  47.95 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0978  ribose-5-phosphate isomerase A  48.61 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3877  ribose-5-phosphate isomerase A  45.13 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0974  ribose-5-phosphate isomerase A  48.61 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1012  ribose-5-phosphate isomerase A  48.61 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  42.33 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0855  ribose-5-phosphate isomerase A  46.19 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000367757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  42.79 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3822  ribose-5-phosphate isomerase A  46.19 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0858  ribose-5-phosphate isomerase A  46.19 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  44.12 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  42.33 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  42.33 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0898  ribose-5-phosphate isomerase A  48.15 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000872466 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1150  ribose-5-phosphate isomerase A  48.15 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2667  ribose-5-phosphate isomerase A  46.64 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>