More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4411 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
438 aa  866    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  58.46 
 
 
448 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  60.53 
 
 
452 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  63.05 
 
 
410 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  63.46 
 
 
411 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  61.58 
 
 
452 aa  488  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  60.96 
 
 
416 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  58.09 
 
 
433 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  60.96 
 
 
416 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  60.96 
 
 
416 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  62.16 
 
 
430 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  58.13 
 
 
413 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  62.72 
 
 
451 aa  478  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  59.42 
 
 
457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  59.48 
 
 
472 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  54.04 
 
 
486 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  54.12 
 
 
447 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  53.64 
 
 
447 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  56.56 
 
 
449 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  53.64 
 
 
448 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  62.64 
 
 
462 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  58.17 
 
 
466 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  56.02 
 
 
449 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  61.27 
 
 
458 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  54.21 
 
 
447 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  55.66 
 
 
447 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  51.51 
 
 
441 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  53.2 
 
 
436 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  52.64 
 
 
441 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  55.19 
 
 
445 aa  398  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  46.43 
 
 
420 aa  346  5e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  50.15 
 
 
341 aa  325  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.61 
 
 
349 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  50.61 
 
 
349 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  49.41 
 
 
364 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  49.85 
 
 
349 aa  322  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  50 
 
 
348 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.91 
 
 
329 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.29 
 
 
337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.54 
 
 
330 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.68 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  47.15 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  47.84 
 
 
415 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.61 
 
 
329 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  50.93 
 
 
330 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  45.62 
 
 
369 aa  300  5e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.1 
 
 
354 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
322 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.5 
 
 
344 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  46.32 
 
 
330 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  43.81 
 
 
367 aa  291  2e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.83 
 
 
389 aa  289  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  48.44 
 
 
329 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.3 
 
 
337 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.32 
 
 
331 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  46.23 
 
 
338 aa  285  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  44.41 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  43.58 
 
 
353 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  48.72 
 
 
340 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.61 
 
 
341 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 
357 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  48.72 
 
 
340 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.61 
 
 
341 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  44.69 
 
 
342 aa  279  8e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  44.87 
 
 
354 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  47.62 
 
 
319 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.62 
 
 
353 aa  277  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  42.7 
 
 
353 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.82 
 
 
339 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  45.82 
 
 
317 aa  277  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  44.38 
 
 
354 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.09 
 
 
339 aa  276  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.2 
 
 
366 aa  276  7e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  44.66 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  48.29 
 
 
323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  44.38 
 
 
354 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  44.89 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  42.66 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.91 
 
 
358 aa  272  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  45.59 
 
 
354 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  47.96 
 
 
317 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43.87 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  48.09 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  44.98 
 
 
354 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  44.38 
 
 
340 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  45.93 
 
 
328 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.75 
 
 
348 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.81 
 
 
329 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  43.03 
 
 
343 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.24 
 
 
337 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  44.97 
 
 
358 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  43.49 
 
 
354 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  43.49 
 
 
333 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  43.49 
 
 
352 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  43.49 
 
 
352 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
354 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  43.49 
 
 
354 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  43.49 
 
 
354 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  43.49 
 
 
352 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>