More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2827 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  100 
 
 
223 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  67.89 
 
 
218 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  69.78 
 
 
252 aa  271  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  65.32 
 
 
231 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  63.8 
 
 
240 aa  254  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  54.55 
 
 
268 aa  214  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  53.78 
 
 
255 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  59.21 
 
 
243 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  55.41 
 
 
269 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  46.98 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  60.95 
 
 
242 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  53.7 
 
 
230 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  51.6 
 
 
244 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  54.3 
 
 
228 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19860  cytidylate kinase  50.22 
 
 
250 aa  191  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  52.97 
 
 
228 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  52.97 
 
 
228 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  52.97 
 
 
228 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  53.74 
 
 
230 aa  191  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  56.82 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.12 
 
 
528 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  45.75 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  45.75 
 
 
225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  46.19 
 
 
225 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  55.66 
 
 
228 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.18 
 
 
534 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.47 
 
 
526 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  44.19 
 
 
225 aa  181  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.98 
 
 
511 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.98 
 
 
511 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  52.05 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  45.28 
 
 
225 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  47.98 
 
 
223 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  48.37 
 
 
224 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  45.91 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  45.71 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.19 
 
 
527 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.73 
 
 
539 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  44.24 
 
 
227 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1926  cytidylate kinase  51.57 
 
 
232 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.21 
 
 
529 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.89 
 
 
232 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  53.49 
 
 
226 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.64 
 
 
228 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.55 
 
 
517 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  43.18 
 
 
232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  45.5 
 
 
233 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.93 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  54.3 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  45.07 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.84 
 
 
514 aa  170  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  42.59 
 
 
226 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.34 
 
 
221 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  45.74 
 
 
240 aa  167  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  38.71 
 
 
213 aa  167  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  41.33 
 
 
232 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  44.29 
 
 
227 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  44.7 
 
 
217 aa  166  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.25 
 
 
483 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.01 
 
 
480 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  41.43 
 
 
223 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  43.69 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  41.86 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  40.64 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.79 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  44.19 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  45.02 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.08 
 
 
488 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  43.5 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.63 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.47 
 
 
516 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.25 
 
 
516 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  41.36 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  45.74 
 
 
243 aa  161  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  44.13 
 
 
213 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  47.51 
 
 
223 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  44.19 
 
 
227 aa  159  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  41.01 
 
 
223 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  47.37 
 
 
223 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43.38 
 
 
227 aa  158  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  40.81 
 
 
231 aa  158  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  54.75 
 
 
227 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.67 
 
 
233 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  44.34 
 
 
225 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  40.74 
 
 
229 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  34.27 
 
 
222 aa  156  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  46.12 
 
 
755 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  41.44 
 
 
230 aa  155  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  45.71 
 
 
237 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  44.65 
 
 
232 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3117  cytidylate kinase  49.34 
 
 
263 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  44.09 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  46.45 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  44.09 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  44.09 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>