More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1542 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  62.54 
 
 		 670 aa  822    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 697 aa  1411    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  61.14 
 
 		 692 aa  793    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  51.79 
 
 		 716 aa  734    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  57.66 
 
 		 686 aa  791    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  51.56 
 
 		 764 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  49.11 
 
 		 724 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  49.34 
 
 		 729 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  46.29 
 
 		 708 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0751  peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 		 772 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.810278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09230  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.73 
 
 		 760 aa  491  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.922372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  35.38 
 
 		 646 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  34.22 
 
 		 667 aa  337  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 		 661 aa  330  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 658 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  35.95 
 
 		 655 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 687 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  31.8 
 
 		 644 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  33.08 
 
 		 724 aa  296  6e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  31.47 
 
 		 716 aa  296  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 671 aa  290  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  31.05 
 
 		 669 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  30.9 
 
 		 709 aa  279  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.09 
 
 		 639 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 643 aa  270  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.31 
 
 		 574 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 709 aa  265  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 		 636 aa  264  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 		 646 aa  264  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 636 aa  261  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.79 
 
 		 647 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.43 
 
 		 645 aa  260  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  31.55 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.41 
 
 		 619 aa  259  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.19 
 
 		 611 aa  256  8e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 		 619 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.75 
 
 		 642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 		 678 aa  253  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 		 628 aa  253  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 		 703 aa  252  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  29.91 
 
 		 610 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  28.7 
 
 		 640 aa  250  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  27.19 
 
 		 625 aa  249  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  28.93 
 
 		 628 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  29.59 
 
 		 600 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 		 602 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  28.59 
 
 		 637 aa  246  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  29.38 
 
 		 801 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 		 596 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 		 640 aa  246  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 		 662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 		 691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  30.35 
 
 		 647 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 662 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.47 
 
 		 761 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 		 635 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  26.72 
 
 		 645 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  26.85 
 
 		 755 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  29.88 
 
 		 640 aa  244  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 		 775 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  29.58 
 
 		 669 aa  243  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 630 aa  242  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.13 
 
 		 629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 664 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  29.14 
 
 		 602 aa  241  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  30.82 
 
 		 602 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  31.42 
 
 		 670 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 		 631 aa  241  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  29.14 
 
 		 602 aa  241  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  28.36 
 
 		 801 aa  240  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 648 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 648 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 		 605 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 		 633 aa  239  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  30.4 
 
 		 663 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.25 
 
 		 629 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.2 
 
 		 629 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 		 629 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  26.24 
 
 		 701 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  27.99 
 
 		 635 aa  239  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 		 624 aa  238  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  28.21 
 
 		 801 aa  237  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.93 
 
 		 618 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 		 595 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  28.96 
 
 		 652 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  29.36 
 
 		 630 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  29.31 
 
 		 626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  27.71 
 
 		 697 aa  234  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  28.76 
 
 		 681 aa  233  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  27.95 
 
 		 588 aa  233  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  28.88 
 
 		 771 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 		 637 aa  233  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 		 683 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 630 aa  231  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  27.59 
 
 		 689 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  28.4 
 
 		 617 aa  231  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 		 646 aa  231  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 		 808 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 		 689 aa  231  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  31.53 
 
 		 600 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>