More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1381 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 259 aa  510  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  35.95 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  37.6 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  32.32 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.76 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  36.47 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  33.74 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  25.51 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  34.27 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  36.21 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  33.87 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  38.81 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  33.61 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.8 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.88 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  36.72 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.84 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  33.8 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.46 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.46 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.78 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  29.02 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.02 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.02 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  29.02 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.02 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  35.98 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.2 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.2 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  33.74 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.38 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.63 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.38 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.38 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.38 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.78 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.78 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.78 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  34.93 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>