More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1334 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 335 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  49.84 
 
 		 454 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  53.31 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  47.15 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  51.46 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  50.88 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  50.96 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  46.53 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  47.04 
 
 		 336 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  48.2 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  43.08 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  42.27 
 
 		 388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  40.13 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  47.69 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  43.32 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  43.32 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  42.96 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  44.64 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  45.04 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  42.96 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  49.82 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  41.7 
 
 		 538 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  39.37 
 
 		 528 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  42.01 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  39.37 
 
 		 528 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  39.55 
 
 		 537 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 550 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  41.28 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  50.47 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  42.08 
 
 		 394 aa  175  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  42.55 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  41.89 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  35.42 
 
 		 599 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  42.72 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  40.81 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  35.32 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  38.46 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  35.32 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  42.13 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  35.69 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  36.14 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  36.14 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  36.45 
 
 		 568 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  36.14 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 308 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  36.14 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  38.46 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 718 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  39.04 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  38.22 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  38.22 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  39.81 
 
 		 288 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 719 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  44.25 
 
 		 221 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  42.63 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  37.56 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  40.67 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  39.82 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  34.23 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  37.96 
 
 		 289 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  37.24 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  39.25 
 
 		 756 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  40.93 
 
 		 228 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 773 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  37.44 
 
 		 717 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  37.9 
 
 		 735 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  36.8 
 
 		 787 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 717 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  37.34 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  42.05 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  36.7 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 715 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  37.56 
 
 		 767 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  37.44 
 
 		 735 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  37.1 
 
 		 879 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  37.33 
 
 		 876 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 787 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 787 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  35.98 
 
 		 771 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 		 693 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 762 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 753 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 595 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  37.85 
 
 		 759 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>