275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0537 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  70.38 
 
 
261 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.2 
 
 
269 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.35 
 
 
261 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.83 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  46.9 
 
 
267 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.67 
 
 
262 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  46.99 
 
 
262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.2 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  45.85 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.22 
 
 
262 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.04 
 
 
262 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.74 
 
 
263 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.39 
 
 
262 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  45.85 
 
 
262 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  45.45 
 
 
262 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.59 
 
 
268 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.18 
 
 
267 aa  198  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.49 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.49 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.38 
 
 
262 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.44 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.72 
 
 
264 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.15 
 
 
260 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  39.44 
 
 
260 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.13 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.17 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  41.74 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  37.6 
 
 
260 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.18 
 
 
267 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.6 
 
 
260 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.6 
 
 
261 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.53 
 
 
261 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.22 
 
 
259 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.25 
 
 
264 aa  178  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  36.43 
 
 
262 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.88 
 
 
260 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.32 
 
 
266 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.21 
 
 
260 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.21 
 
 
260 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.11 
 
 
262 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.7 
 
 
259 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.13 
 
 
255 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.16 
 
 
259 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.46 
 
 
254 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.75 
 
 
254 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.02 
 
 
268 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.43 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.52 
 
 
260 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  38 
 
 
271 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  43.97 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.74 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  41.03 
 
 
266 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.67 
 
 
264 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  38.61 
 
 
267 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.8 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.74 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.07 
 
 
267 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  38.22 
 
 
267 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.15 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.18 
 
 
263 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  39.92 
 
 
255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  41.18 
 
 
259 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  42.23 
 
 
256 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.94 
 
 
257 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.93 
 
 
260 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  38.16 
 
 
264 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.6 
 
 
260 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.31 
 
 
260 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40 
 
 
274 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.4 
 
 
260 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.94 
 
 
266 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.04 
 
 
257 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.06 
 
 
260 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.5 
 
 
261 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.5 
 
 
261 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.86 
 
 
266 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.55 
 
 
261 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.68 
 
 
267 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.64 
 
 
264 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.9 
 
 
261 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.91 
 
 
257 aa  151  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.87 
 
 
265 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.77 
 
 
259 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.45 
 
 
262 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.38 
 
 
261 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2010  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.88 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.74 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.65 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.86 
 
 
267 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  34.9 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.34 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  34.9 
 
 
273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.9 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.9 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.67 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8638  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.57 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423963  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.76 
 
 
267 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  36 
 
 
269 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.55 
 
 
261 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>