249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1076 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  56.73 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  48.79 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  48.31 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  48.31 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  48.31 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  48.31 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  48.31 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  48.31 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  48.31 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  50.72 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  49.28 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  47.83 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  47.83 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  49.28 
 
 		 205 aa  197  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  47.83 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  47.83 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  47.83 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  49.28 
 
 		 205 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  46.86 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  48.79 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  46.86 
 
 		 205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  48.79 
 
 		 205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  45.67 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  46.15 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  46.15 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  45.67 
 
 		 205 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  50.24 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  44.93 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  45.41 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  45.41 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  45.41 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  45.41 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  47.83 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  45.41 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  44.5 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  44.83 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  45.5 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  43.63 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  48.79 
 
 		 205 aa  158  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  41.46 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  43.63 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  41 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  42.65 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  41.67 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  41.67 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  40.69 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  42.16 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  41.41 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  42.79 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  39.22 
 
 		 214 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  43.9 
 
 		 216 aa  150  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  40.78 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  39.22 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  42.93 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  40.2 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  43.63 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  40.69 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  39.5 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  43.56 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  40.3 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0747  Hly-III family protein  40.1 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  40.98 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  40.69 
 
 		 257 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  41.75 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  41.75 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  41.75 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  41.75 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  42.29 
 
 		 241 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  41.75 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  40.69 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  41.87 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  43.56 
 
 		 518 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  40.98 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  41.18 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  41.58 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.666008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  39.5 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  39.22 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  44.28 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  39.32 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  39.32 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  39.5 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  42.77 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  37.38 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  41.38 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  40.89 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  41.46 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>