More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2688 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 347 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  71.01 
 
 		 343 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  62.9 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  59.77 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  59.09 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  60.4 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  59.94 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  60 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 350 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  51.74 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  48.53 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  47.95 
 
 		 372 aa  249  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  49.7 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  35.82 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  41.32 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  42.14 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 383 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  44.26 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  44.26 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  44.26 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  43.22 
 
 		 358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  42.22 
 
 		 361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  49.42 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.16 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  50 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.16 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 386 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 386 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 386 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  37.21 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.2 
 
 		 384 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  43.29 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.2 
 
 		 388 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  39.56 
 
 		 388 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  42.95 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  42.95 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  40.48 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.75 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  42.63 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  45.95 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  45.95 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  41.67 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  40.48 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.2 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.06 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.64 
 
 		 352 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.61 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1576  ABC transporter related  41.76 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224014  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.3 
 
 		 384 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.3 
 
 		 384 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 371 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  46.64 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  42.62 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  43.64 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.74 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.21 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.3 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  38.97 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  44.61 
 
 		 350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  50.46 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.3 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  50.46 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  50.46 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  47.52 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.64 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  41.49 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  42.59 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  49.3 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.51 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  35.6 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  39.64 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.71 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  49.53 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.76 
 
 		 381 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.86 
 
 		 362 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>