More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3761 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  627  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  52.54 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  52.26 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.54 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  50.85 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  50.85 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  48.63 
 
 		 317 aa  278  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  34.85 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  35.44 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  33.56 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  32.39 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  33.45 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  33.67 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.18 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  31.85 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  32.87 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  31.29 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  33.09 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.92 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.14 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.86 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.86 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.14 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  28.73 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.68 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.55 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  34.66 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  31.53 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  31.54 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.7 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  30.32 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.09 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  30.21 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  29.86 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  29.86 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.28 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.6 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.29 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  27.82 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  28.72 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.43 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  28.73 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  27.47 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  32.09 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  32.09 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  30.94 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.1 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  29.56 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  31.71 
 
 		 301 aa  99.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  26.06 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  30.6 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  28.33 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  28.41 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.33 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  24.91 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  26.01 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  29.54 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  27.93 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.08 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  32.81 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  30.58 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  28.36 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  29.79 
 
 		 294 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  28.86 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  30.47 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  30.3 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  25.52 
 
 		 301 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  33.04 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  27.81 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.93 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  31.54 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  32.12 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.08 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  31.96 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.46 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.78 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  30.14 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  30.14 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  27.4 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  26.85 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  28.62 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  89.4  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  30.1 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>