202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2940 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 482 aa  969    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  43.21 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 		 486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  35.34 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  36.21 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  35.8 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  35.8 
 
 		 481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  32.57 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  30.91 
 
 		 618 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  25.81 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  30.56 
 
 		 623 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.4 
 
 		 622 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  26.75 
 
 		 727 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  29.17 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  29.75 
 
 		 623 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 		 486 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  28.09 
 
 		 626 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 		 632 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  30.54 
 
 		 623 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  24.49 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  28.89 
 
 		 632 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  28.89 
 
 		 632 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  27.04 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  29.22 
 
 		 627 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  29.79 
 
 		 623 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  24.49 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 		 487 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 623 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  24.65 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  25.69 
 
 		 495 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  25.38 
 
 		 611 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  24.85 
 
 		 487 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.33 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  28.57 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  22.75 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  24.44 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  26.03 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  24.75 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.11 
 
 		 623 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  24.48 
 
 		 503 aa  76.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  27.71 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  23.77 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  24.9 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 		 637 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 566 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 		 713 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 588 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  26.71 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  26.71 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.71 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  22.82 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  24.63 
 
 		 704 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  23.36 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 683 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  22.82 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  23.55 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  26.03 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  23.18 
 
 		 858 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  26.48 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  25.08 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  25.08 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.91 
 
 		 858 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  25.15 
 
 		 647 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  23.72 
 
 		 695 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.33 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  23.95 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  22.44 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.23 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  23.22 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  24.79 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  24.75 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  22.04 
 
 		 818 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  22.95 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  25.99 
 
 		 637 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  26.61 
 
 		 653 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  24.51 
 
 		 641 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  26.83 
 
 		 680 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 		 645 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  26.52 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>