204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2512 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 327 aa  661    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  43.16 
 
 		 317 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  40.42 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  42.68 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.58 
 
 		 631 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  47.65 
 
 		 738 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.43 
 
 		 629 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.99 
 
 		 622 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.94 
 
 		 723 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.07 
 
 		 622 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.51 
 
 		 643 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 626 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  42.6 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  44.05 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  36.41 
 
 		 603 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  41.24 
 
 		 647 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  43.86 
 
 		 647 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  37.24 
 
 		 642 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  43.27 
 
 		 647 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.86 
 
 		 588 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  39.49 
 
 		 652 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  42.11 
 
 		 648 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.5 
 
 		 595 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.82 
 
 		 568 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 		 667 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.35 
 
 		 624 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.11 
 
 		 598 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.23 
 
 		 634 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  35.29 
 
 		 581 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.07 
 
 		 568 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  37.13 
 
 		 664 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.2 
 
 		 658 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 597 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.58 
 
 		 596 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  43.08 
 
 		 150 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  33.73 
 
 		 408 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  32.84 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 		 1160 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  27.21 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 1392 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  34.51 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 		 665 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 		 1037 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  37.86 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  37.86 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  37.86 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  29.31 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.9 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 		 1046 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  31.13 
 
 		 1358 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.05 
 
 		 1087 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  31.21 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 		 735 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  25.67 
 
 		 638 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  29.55 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  26.16 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.14 
 
 		 600 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.23 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.67 
 
 		 577 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 		 1027 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 		 1027 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 		 1027 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 		 536 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 		 449 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  29.84 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 		 449 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 		 449 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.15 
 
 		 1053 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 		 1142 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.61 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 		 483 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  30.08 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  36.26 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  26.6 
 
 		 518 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 		 633 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2975  adenylate/guanylate cyclase  25.58 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.931348  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  30.32 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3019  putative adenylate/guanylate cyclase  25.58 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 		 1048 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25.64 
 
 		 1139 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  29.36 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2958  adenylate/guanylate cyclase  27.96 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000879483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>