213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1338 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  100 
 
 		 302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2307  PfkB  60.88 
 
 		 296 aa  328  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.013346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  61.37 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  49.83 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  47.62 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6216  carbohydrate kinase PfkB family  46.41 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 374 aa  92.8  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.88 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  29.06 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 363 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  31.08 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  26.33 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  32.38 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  28.78 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  29.14 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  28.78 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  28.78 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  28.41 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.57 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  28.41 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  28.41 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  28.41 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  31.2 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  25.89 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  26.1 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  26.22 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  26.2 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  29.57 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  28.86 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  26.71 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  29.24 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  29.24 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  29.24 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  31.32 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  29.24 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  29.24 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.76 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.13 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.48 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  28.57 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  21.89 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.69 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.95 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.51 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  29.07 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  30.07 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  27.87 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.36 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  29.58 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  24.23 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  25.5 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  27.06 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  28.52 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  24.83 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  24.83 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  24.83 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  24.65 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.78 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  23.67 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  27.51 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  24.74 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  21.79 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  25.89 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  27.51 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  25.82 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  26.83 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  25.26 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  25.77 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  31.52 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  24.91 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.67 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  24.3 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  27.8 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  24.84 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  24.75 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  24.22 
 
 		 319 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  24.4 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  28.99 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  36.96 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  20.81 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  26.73 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  24.4 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.24 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  23.71 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  24.25 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  21.57 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>