More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2059 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2059  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 406 aa  791    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3149  hypothetical protein  42.82 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.927452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  30.93 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  29.66 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  31.23 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  30.16 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  29.13 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.82 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  29.02 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  29.02 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  29.02 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  29.02 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  29.06 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  29.13 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  29.03 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  30.49 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.89 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.49 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  27.04 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.61 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.72 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.72 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.25 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.75 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  27.78 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.06 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  25.58 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.65 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  25.9 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.14 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  28.62 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.61 
 
 		 418 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.55 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.57 
 
 		 357 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  29.67 
 
 		 361 aa  96.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  28.36 
 
 		 347 aa  96.3  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  28.36 
 
 		 347 aa  96.3  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.66 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.96 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.71 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  25.78 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  28.21 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.8 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  27.81 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  28.41 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.03 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1689  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 379 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 		 370 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  29.14 
 
 		 370 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  24.85 
 
 		 367 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  27.53 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.56 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  24.77 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.74 
 
 		 329 aa  92  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  28.88 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  24.01 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  27.24 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  25.57 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.97 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.94 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  27.67 
 
 		 348 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  27.75 
 
 		 366 aa  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  25.96 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.61 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.98 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.98 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  23.44 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.98 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.94 
 
 		 368 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.15 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  28.81 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.98 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  28.81 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.68 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.68 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  27.42 
 
 		 547 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.35 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  25.94 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  25.82 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  29.33 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.68 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.68 
 
 		 348 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.76 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.68 
 
 		 361 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>