More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1378 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1378  type II secretion system protein E  100 
 
 		 419 aa  850    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.361275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 553 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  37.43 
 
 		 570 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.63 
 
 		 555 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 520 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.47 
 
 		 561 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  38.62 
 
 		 553 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  37.63 
 
 		 560 aa  263  4e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  36.68 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  36.41 
 
 		 520 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  36.17 
 
 		 787 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  36.44 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  38.2 
 
 		 578 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1621  type II secretion system protein E  37.89 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 637 aa  255  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  36.15 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  35.01 
 
 		 571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.77 
 
 		 570 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.63 
 
 		 559 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  36.15 
 
 		 520 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  37.83 
 
 		 494 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 561 aa  253  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  36.67 
 
 		 561 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.07 
 
 		 563 aa  253  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3898  type II secretion system protein E  36.68 
 
 		 648 aa  253  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000434114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 417 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  36.27 
 
 		 566 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  37.24 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.56 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  40.48 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  35.62 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  35.98 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  35.25 
 
 		 578 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  36.97 
 
 		 511 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  35.44 
 
 		 520 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 586 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 586 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 586 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  37.67 
 
 		 586 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  35.28 
 
 		 392 aa  250  4e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 586 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  37.91 
 
 		 571 aa  250  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  35.03 
 
 		 570 aa  250  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 574 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.83 
 
 		 571 aa  249  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 586 aa  249  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  37.53 
 
 		 585 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0349  type II secretion system protein E  35.05 
 
 		 638 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000754733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  37.2 
 
 		 570 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  35.97 
 
 		 527 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  36.97 
 
 		 484 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  39.88 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  37.4 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 482 aa  247  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1644  general secretory pathway protein E  34.58 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 558 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1464  general secretory pathway protein E  34.58 
 
 		 519 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  35.86 
 
 		 494 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 564 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  34.22 
 
 		 568 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.25 
 
 		 568 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0368  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 638 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  34.26 
 
 		 603 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  33.95 
 
 		 568 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 558 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  34.85 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  34.85 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.37 
 
 		 568 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 584 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.77 
 
 		 577 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  36.9 
 
 		 569 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  35.81 
 
 		 586 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  34.76 
 
 		 599 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.95 
 
 		 568 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  34.85 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  34.85 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  34.85 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.37 
 
 		 568 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.77 
 
 		 577 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2457  type II secretion system protein E  35.2 
 
 		 623 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  35.5 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  36.63 
 
 		 573 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  37.24 
 
 		 563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1351  type II secretion system protein GspE  33.6 
 
 		 778 aa  243  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0082  type II secretion system protein E  34.43 
 
 		 600 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214348  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 553 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2020  type II secretion system protein E  39.22 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  36.81 
 
 		 564 aa  243  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 580 aa  243  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  36.09 
 
 		 554 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.77 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 557 aa  243  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  35.71 
 
 		 587 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  34.76 
 
 		 599 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1818  general secretory pathway protein E  34.05 
 
 		 519 aa  243  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  35.73 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.31 
 
 		 563 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>