More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2424 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2424  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.551126  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0394  50S ribosomal protein L1  52.49 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.351464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  50.89 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 235 aa  231  6e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1955  ribosomal protein L1  48.64 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  48.88 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  47.79 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  48.18 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  48 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  50.91 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  49.11 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  50 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  47.09 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  47.09 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  47.98 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  48.88 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  47.32 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  47.98 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  46.64 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  47.53 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  49.11 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  46.64 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  47.98 
 
 		 253 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  47.81 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  46.49 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  47.98 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  48.66 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  47.32 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  46.02 
 
 		 237 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  45.74 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  50.97 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  48.88 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  46.26 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  45.29 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  48.88 
 
 		 230 aa  208  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  47.09 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  44.93 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  48.88 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  48.2 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  47.32 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  49.09 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  51.22 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  47.58 
 
 		 242 aa  205  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  47.73 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  46.36 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  44.05 
 
 		 238 aa  204  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  46.67 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  47.32 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  46.96 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2952  ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00907027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  45.61 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  47.77 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0270  50S ribosomal protein L1  47.98 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000998877  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  47.77 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  46.88 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  47.79 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  45.09 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  47.3 
 
 		 238 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  44.39 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  47.14 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  43.05 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  47.14 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  47.14 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>