More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0847 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0847  lipoyl synthase  100 
 
 
308 aa  641    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  44.22 
 
 
321 aa  261  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  45.99 
 
 
306 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  45 
 
 
292 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  46.83 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  44.17 
 
 
303 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  44.17 
 
 
303 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  46.74 
 
 
312 aa  258  8e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  46.93 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  46.07 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  43.15 
 
 
398 aa  253  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  46.72 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2079  lipoyl synthase  45.67 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  44.91 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  47.04 
 
 
291 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  44.48 
 
 
297 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  45.45 
 
 
294 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  45.3 
 
 
300 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  46.1 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  43.49 
 
 
312 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  44.91 
 
 
289 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  45.23 
 
 
294 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  45.65 
 
 
290 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  43.51 
 
 
291 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  46.91 
 
 
288 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  41.53 
 
 
310 aa  248  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  42.01 
 
 
334 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  45.83 
 
 
326 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  43.16 
 
 
368 aa  247  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  44.56 
 
 
289 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  45.49 
 
 
326 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  42.45 
 
 
335 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  44.86 
 
 
326 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  43.51 
 
 
289 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  42.24 
 
 
325 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  41.61 
 
 
297 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  43.48 
 
 
292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  46.62 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  45.42 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  44.33 
 
 
298 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  43.62 
 
 
287 aa  245  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  44.95 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  45.33 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  44.95 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  45.32 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  45.33 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  44.95 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  45.99 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  44.95 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  44.95 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  45.99 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  45.99 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17061  lipoyl synthase  42.11 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  44.84 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  43.06 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  46.37 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  46.98 
 
 
321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  41.24 
 
 
348 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  44.36 
 
 
309 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  46.93 
 
 
314 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  37.94 
 
 
401 aa  242  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  42.96 
 
 
311 aa  242  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  44.95 
 
 
321 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  45.77 
 
 
296 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  41.58 
 
 
329 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  43.46 
 
 
288 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  45.14 
 
 
298 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  44.29 
 
 
304 aa  240  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  44.29 
 
 
326 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  45.52 
 
 
314 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  44.06 
 
 
307 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  44.1 
 
 
324 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  44.64 
 
 
321 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  40.33 
 
 
302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1080  lipoyl synthase  44.41 
 
 
289 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  43.26 
 
 
331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19551  lipoyl synthase  44.41 
 
 
289 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  44.73 
 
 
291 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  43.12 
 
 
300 aa  239  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0328  lipoyl synthase  44.76 
 
 
289 aa  239  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0868642 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  46.26 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  44.88 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17181  lipoyl synthase  42.66 
 
 
297 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.49341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  41.28 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  43.21 
 
 
287 aa  238  8e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  41.94 
 
 
350 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  44.6 
 
 
321 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  44.6 
 
 
321 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1709  lipoyl synthase  45 
 
 
328 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  44.6 
 
 
321 aa  237  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  44.6 
 
 
355 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>