More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13894 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 488 aa  993    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  66.73 
 
 		 494 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  75.62 
 
 		 484 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  71.57 
 
 		 485 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.27 
 
 		 485 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  78.6 
 
 		 488 aa  796    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  67.47 
 
 		 495 aa  664    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  72.93 
 
 		 480 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  66.8 
 
 		 492 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  82.96 
 
 		 489 aa  819    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  70.84 
 
 		 481 aa  676    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  64.9 
 
 		 486 aa  636    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  68.85 
 
 		 484 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  81.84 
 
 		 492 aa  811    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  82.96 
 
 		 489 aa  819    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.53 
 
 		 487 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  82.72 
 
 		 488 aa  822    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  82.82 
 
 		 491 aa  824    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  67 
 
 		 493 aa  628  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  68.9 
 
 		 486 aa  624  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  62.32 
 
 		 485 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.8 
 
 		 488 aa  613  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  62.32 
 
 		 485 aa  597  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.83 
 
 		 491 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.3 
 
 		 488 aa  588  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.07 
 
 		 487 aa  591  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.87 
 
 		 471 aa  581  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.55 
 
 		 488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.46 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.19 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.84 
 
 		 487 aa  551  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.73 
 
 		 500 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  54.66 
 
 		 488 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  55.65 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.63 
 
 		 475 aa  537  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  53.27 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.1 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  54.86 
 
 		 488 aa  535  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.02 
 
 		 478 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  53.52 
 
 		 491 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.61 
 
 		 492 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.44 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.3 
 
 		 502 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.53 
 
 		 501 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.08 
 
 		 501 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.71 
 
 		 501 aa  527  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  57.71 
 
 		 502 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  54.66 
 
 		 488 aa  525  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.3 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.1 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  54.86 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  54.86 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.1 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  54.02 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  56.28 
 
 		 487 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.06 
 
 		 482 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  53.33 
 
 		 489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  53.31 
 
 		 502 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  52.23 
 
 		 488 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  52.81 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  53.54 
 
 		 489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  52.92 
 
 		 512 aa  511  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  52.72 
 
 		 491 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  54.25 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  53.01 
 
 		 492 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  53.53 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  53.97 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  53.44 
 
 		 487 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  54.45 
 
 		 480 aa  511  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  54.14 
 
 		 487 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  54.14 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  59.23 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  51.75 
 
 		 489 aa  501  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  55.47 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.74 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.95 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  51.75 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  54.66 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.91 
 
 		 495 aa  498  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  55.47 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  51.54 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.2 
 
 		 501 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  54.66 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.47 
 
 		 491 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  51.33 
 
 		 490 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 506 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.93 
 
 		 489 aa  492  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  54.05 
 
 		 487 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  52.55 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  54.25 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  53.21 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  53.01 
 
 		 492 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  54.25 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  52.55 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>