More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13731 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13731  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  759    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.931634  normal  0.801703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5246  aminotransferase, class V  69.44 
 
 		 375 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.728541  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4878  aminotransferase, class V  69.44 
 
 		 375 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4967  aminotransferase, class V  69.44 
 
 		 375 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1319  aminotransferase, class V  60.65 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.415284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5482  aminotransferase, class V  59.17 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362995  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0198  aminotransferase class V  54.96 
 
 		 376 aa  346  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0981  aminotransferase class V  46.58 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4836  aminotransferase class V  39.25 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0889282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  39.23 
 
 		 409 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2218  aminotransferase class V  39.68 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245886  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1683  hypothetical protein  35.67 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0813742  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  31.75 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  30.67 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  29.61 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  30.03 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  29.09 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  27.1 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.53 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  30.46 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.33 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  27.48 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  23.2 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  28.17 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  27.47 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  23.86 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  28.39 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  24.64 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.85 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  27.42 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.09 
 
 		 664 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  29.57 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  27.15 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.6 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  24.93 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.78 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.11 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  23.56 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.26 
 
 		 672 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.17 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.26 
 
 		 674 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  35.05 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  26.61 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.73 
 
 		 641 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.59 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.5 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  30.77 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.11 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.64 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.44 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  29.51 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.5 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  26.49 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  22.29 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.11 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  29.46 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  27.47 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  30.99 
 
 		 487 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  23.1 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.53 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  28.65 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  26.75 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.28 
 
 		 679 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.13 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  26.98 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  36.41 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.73 
 
 		 644 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.6 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  27.08 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0567  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.82 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.93631  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  29.35 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  28.64 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  30.32 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.37 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.94 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  27.44 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.67 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.82 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  25.33 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.32 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  25.92 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.83 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  25 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.92 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  29.89 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  26.37 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  23.46 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3676  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0159839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0462  cysteine desulfurase  25.45 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  31.49 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  30.22 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  29.02 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.58 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  26.58 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.72 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01901  NifS-like aminotransferase class-V  25.53 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  23.65 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  25.97 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>