More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0198 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0198  aminotransferase class V  100 
 
 		 376 aa  716    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13731  hypothetical protein  54.74 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.931634  normal  0.801703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5246  aminotransferase, class V  53.22 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.728541  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4878  aminotransferase, class V  53.22 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4967  aminotransferase, class V  53.22 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1319  aminotransferase, class V  50 
 
 		 370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.415284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5482  aminotransferase, class V  48.43 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362995  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0981  aminotransferase class V  49.46 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4836  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0889282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  43.77 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2218  aminotransferase class V  46.05 
 
 		 426 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245886  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1683  hypothetical protein  41.67 
 
 		 349 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0813742  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  33.97 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  34.36 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  31.89 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  28.91 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  28.34 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  31.62 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  36.48 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  29.89 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  28.14 
 
 		 399 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.46 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.62 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  26.39 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.61 
 
 		 433 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  29.29 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  29.33 
 
 		 430 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  27.74 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.26 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.41 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  32.7 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  29.6 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  29.96 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.12 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.47 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.97 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.09 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.05 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.3 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.39 
 
 		 885 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  27.7 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  29.79 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  39.13 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.17 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  32.08 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  26.61 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.37 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  26.4 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  29.02 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  26.07 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.03 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  30.34 
 
 		 878 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.89 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.03 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  24.61 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.08 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.96 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.77 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.09 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.46 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.44 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.96 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  28.03 
 
 		 666 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.03 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  25.55 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.55 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.39 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  28.37 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  27.86 
 
 		 685 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.81 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.28 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.39 
 
 		 673 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 671 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  24.46 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  27.86 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  27.86 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.57 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  24.09 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  29.49 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.39 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  25.57 
 
 		 665 aa  72.8  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0059  aminotransferase, class V  29.37 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.768398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.68 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  28.3 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.93 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  29.23 
 
 		 433 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.68 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.68 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  25.99 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.05 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  27.38 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  27.34 
 
 		 682 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  32.76 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28 
 
 		 560 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>