More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4836 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4836  aminotransferase class V  100 
 
 		 363 aa  719    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0889282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0198  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0981  aminotransferase class V  43.68 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1319  aminotransferase, class V  39.72 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.415284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4878  aminotransferase, class V  37.33 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4967  aminotransferase, class V  37.33 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5246  aminotransferase, class V  37.33 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.728541  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5482  aminotransferase, class V  38.04 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362995  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13731  hypothetical protein  39.07 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.931634  normal  0.801703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  33.25 
 
 		 409 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2218  aminotransferase class V  34.01 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245886  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1683  hypothetical protein  32.94 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0813742  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  31.18 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  32.47 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  28.65 
 
 		 393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  26.53 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  28.72 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.61 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  28.73 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  23.14 
 
 		 391 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.44 
 
 		 413 aa  89.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  31.36 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.76 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  28.92 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  29.13 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  29.6 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.3 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  25.4 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.68 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  27.49 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  25.26 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  24.74 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.11 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.92 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.62 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.46 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  24.01 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  25.31 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.46 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  28.07 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  24.35 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  21.67 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.87 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  26.26 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0059  aminotransferase, class V  25.69 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.768398  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.93 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.71 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  21.5 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.7 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  24.47 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.67 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  25.45 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  29.75 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  23.13 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.34 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.15 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.27 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  23.13 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  26.76 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.38 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.19 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  27.63 
 
 		 425 aa  67  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.51 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  24.54 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  20.68 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  25.85 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.91 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  24.67 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.61 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.37 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.56 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  23.53 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  21.29 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  25.13 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  29.2 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.08 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.08 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.29 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.95 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  26.98 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  28 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  22.25 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.22 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  20.1 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.85 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.78 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  26.16 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.56 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  26.35 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  24.59 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.95 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.91 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.74 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>