More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2218 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2218  aminotransferase class V  100 
 
 		 426 aa  812    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245886  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1683  hypothetical protein  56.73 
 
 		 349 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0813742  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  43.1 
 
 		 409 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0198  aminotransferase class V  45.43 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4878  aminotransferase, class V  39.12 
 
 		 375 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5246  aminotransferase, class V  39.12 
 
 		 375 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.728541  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4967  aminotransferase, class V  39.12 
 
 		 375 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1319  aminotransferase, class V  36.22 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.415284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13731  hypothetical protein  39.07 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.931634  normal  0.801703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4836  aminotransferase class V  34.01 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0889282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5482  aminotransferase, class V  34.13 
 
 		 359 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362995  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0981  aminotransferase class V  34.26 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024687  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  35.26 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  29.97 
 
 		 403 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.36 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  29.84 
 
 		 393 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  27.94 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  31.43 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  25.88 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  31.09 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  26.1 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  28.39 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.21 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  29.79 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  29.36 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  24.34 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.96 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  27.64 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  29.09 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.76 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  26.67 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.03 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  29.22 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  28.48 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  29.09 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  29.63 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.75 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.35 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  26.8 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  26.5 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  23.28 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.75 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  26.35 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.25 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  23.28 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.44 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.11 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.44 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  20.48 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  24.1 
 
 		 665 aa  73.6  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.14 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  34.7 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.9 
 
 		 644 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.71 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.18 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.07 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  32.56 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.85 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  20.61 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  23.9 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  25.73 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.25 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.18 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  24.61 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  24.87 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.23 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.05 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  25 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  27.68 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  29.25 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  22.26 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.43 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  22.39 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.5 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.7 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  24.92 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.11 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  26.95 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  22.39 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  27.07 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  22.52 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  28.12 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  22.39 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  27.07 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.65 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  26.9 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  28.48 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  22.39 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  27.67 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  24.94 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39100  cysteine desulfurase, sufS  32.38 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0233253  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.12 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  24.21 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  24.31 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.03 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  22.39 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  22.14 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  22.14 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  22.14 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  25.8 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>