More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13099 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  100 
 
 		 340 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  32.73 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 309 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  29.85 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 347 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  23.72 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  27.73 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  26.51 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  26.03 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  28.57 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.85 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  33.16 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  26.9 
 
 		 335 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  24.21 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  29.47 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  24.53 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  25.53 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3149  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0282952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>