261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11812 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  51.4 
 
 
718 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  52.14 
 
 
733 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  53.47 
 
 
708 aa  671    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  60.08 
 
 
724 aa  834    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  51.12 
 
 
730 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  67.73 
 
 
708 aa  953    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  68.83 
 
 
719 aa  920    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  50.76 
 
 
717 aa  643    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  50.77 
 
 
717 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  68.83 
 
 
719 aa  920    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  68.83 
 
 
719 aa  920    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  67.6 
 
 
730 aa  949    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  100 
 
 
724 aa  1443    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  53.16 
 
 
712 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  50.28 
 
 
717 aa  626  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  51.39 
 
 
721 aa  606  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  49.32 
 
 
717 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  47.23 
 
 
677 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  48.04 
 
 
702 aa  588  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  43.02 
 
 
745 aa  532  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  40.8 
 
 
721 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  40.54 
 
 
749 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  43.42 
 
 
766 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  45.4 
 
 
1169 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  39.53 
 
 
721 aa  490  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  43.9 
 
 
780 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  44.03 
 
 
692 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  47.44 
 
 
757 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  43.53 
 
 
660 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  43.75 
 
 
610 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.26 
 
 
1715 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.64 
 
 
1730 aa  349  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.31 
 
 
1703 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  32.59 
 
 
732 aa  339  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  33.33 
 
 
1464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.21 
 
 
1642 aa  320  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  33.15 
 
 
717 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  36.39 
 
 
1673 aa  313  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  34.38 
 
 
728 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  35.53 
 
 
1662 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.73 
 
 
726 aa  307  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  34.24 
 
 
726 aa  306  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  34.23 
 
 
607 aa  306  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  34.3 
 
 
707 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  32.07 
 
 
694 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  31.52 
 
 
694 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  32.86 
 
 
692 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3143  4-alpha-glucanotransferase  35.72 
 
 
682 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  35.03 
 
 
684 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  30.63 
 
 
731 aa  302  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  37.66 
 
 
605 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  30.27 
 
 
726 aa  301  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  32.35 
 
 
698 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  32.35 
 
 
698 aa  301  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  34.75 
 
 
691 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.53 
 
 
1647 aa  300  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  30.88 
 
 
726 aa  299  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  32.21 
 
 
698 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  34.27 
 
 
656 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 
692 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 
736 aa  297  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  37.17 
 
 
605 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  34.15 
 
 
695 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  31.73 
 
 
736 aa  295  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  36.98 
 
 
605 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  32.78 
 
 
692 aa  294  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  32.23 
 
 
694 aa  293  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  27.89 
 
 
732 aa  293  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  33.72 
 
 
646 aa  293  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 
733 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.68 
 
 
1646 aa  290  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0545  4-alpha-glucanotransferase  33.24 
 
 
669 aa  290  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.650062 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5398  4-alpha-glucanotransferase  34.81 
 
 
630 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229574  hitchhiker  0.00287392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.86 
 
 
1646 aa  289  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  31.74 
 
 
699 aa  289  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 
663 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.43 
 
 
1650 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  32.02 
 
 
694 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  31.98 
 
 
694 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  31.95 
 
 
650 aa  289  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  32.02 
 
 
694 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  31.98 
 
 
694 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  31.98 
 
 
694 aa  287  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  31.98 
 
 
694 aa  287  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4162  4-alpha-glucanotransferase  36.33 
 
 
650 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  31.98 
 
 
694 aa  286  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  31.98 
 
 
694 aa  286  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5113  4-alpha-glucanotransferase  34.04 
 
 
619 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0943987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36590  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.23 
 
 
684 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393735  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  31.78 
 
 
726 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  32.47 
 
 
692 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  32.46 
 
 
689 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  32.31 
 
 
692 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  32.15 
 
 
692 aa  277  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  32.45 
 
 
696 aa  277  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  31.83 
 
 
692 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1850  4-alpha-glucanotransferase  32.37 
 
 
690 aa  276  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3481  4-alpha-glucanotransferase  32.12 
 
 
657 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  34.81 
 
 
664 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  32.64 
 
 
689 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>