More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10126 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10126  serine protease pepA  100 
 
 
355 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.16358e-29  normal  0.942677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4912  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.83 
 
 
341 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.899758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5001  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.83 
 
 
341 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.83 
 
 
341 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5537  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  48.21 
 
 
335 aa  252  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1278  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  49.49 
 
 
297 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4674  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.79 
 
 
423 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.76 
 
 
487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15600  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  36.75 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0395297  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.39 
 
 
392 aa  153  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  37 
 
 
395 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.04 
 
 
280 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  35.34 
 
 
393 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  38.46 
 
 
464 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  36.42 
 
 
423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  36.39 
 
 
584 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.85 
 
 
515 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.74 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  38.2 
 
 
575 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.6 
 
 
515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.67 
 
 
674 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.16 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.37 
 
 
569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  35.81 
 
 
385 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  35.69 
 
 
361 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.17 
 
 
579 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  31.3 
 
 
490 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  34.72 
 
 
491 aa  123  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.45 
 
 
450 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.44 
 
 
392 aa  122  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.18 
 
 
614 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.25 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.39 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.72 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  35.99 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  32.23 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  37.5 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.44 
 
 
916 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.07 
 
 
524 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  32.19 
 
 
373 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.21 
 
 
367 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  32.19 
 
 
377 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.23 
 
 
515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.18 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.25 
 
 
545 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  35.85 
 
 
485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  31.25 
 
 
377 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  33.65 
 
 
453 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  34.06 
 
 
391 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  33.1 
 
 
545 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  33.11 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  35.96 
 
 
594 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  31.98 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.76 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  33.69 
 
 
402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  30.4 
 
 
509 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.76 
 
 
440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.76 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  33.22 
 
 
353 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  36.69 
 
 
597 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.18 
 
 
558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.13 
 
 
423 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  32.9 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.74 
 
 
518 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  34.81 
 
 
411 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  35.61 
 
 
485 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  32.7 
 
 
453 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  34.28 
 
 
496 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  35.05 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  34.27 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  33.54 
 
 
583 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  33.94 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  34.14 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  32.98 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.19 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  33.1 
 
 
498 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  32.99 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  33.8 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  33.86 
 
 
464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  34.97 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  31.74 
 
 
526 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  31.1 
 
 
466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.57 
 
 
512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  32.05 
 
 
511 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  33.46 
 
 
461 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  31.38 
 
 
453 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 
417 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  32.3 
 
 
480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  31.36 
 
 
477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  31.36 
 
 
477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  34.53 
 
 
424 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  33.33 
 
 
508 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  34.85 
 
 
475 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  34.6 
 
 
501 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  30.18 
 
 
418 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  33.66 
 
 
511 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  31.04 
 
 
406 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  34.91 
 
 
385 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  33.92 
 
 
502 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>