220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1571 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1571  MIP family channel protein  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.20348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2523  major intrinsic protein  46.64 
 
 		 279 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218151  normal  0.0321632 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  31.54 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3485  major intrinsic protein  32.13 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1147  major intrinsic protein  32.2 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  33.87 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  33.87 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  26.89 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  26.94 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  30.46 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  29.89 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  30.46 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  30.46 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  30.46 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  26.92 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  30.46 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  29.89 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  32.91 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  30.81 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  30.32 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  27.96 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  29.89 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  30.05 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  28.74 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  29.89 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  29.53 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  25.52 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  29.17 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  30 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  29.23 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  28.8 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0333  major intrinsic protein  31.9 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.881895  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0154  MIP family channel protein  31.9 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  24.35 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  27.46 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  27.6 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  31.64 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  28.65 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  27.37 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  26.27 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  26.92 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  28.37 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  26.23 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  27.6 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4068  Aquaporin Z  27.91 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  25.65 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  29.01 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  29.55 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  25.69 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  26.88 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  26.39 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  27.42 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  29.57 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  28.89 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  26.88 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  26.88 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  27.17 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  25.64 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  25.69 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  28.76 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  26.37 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  25.82 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  25.56 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  27.32 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4329  MIP family channel protein  31.21 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  28.19 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  27.57 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  26.8 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  25.26 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  25.13 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  26.19 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  25.79 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  29.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  29.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  29.1 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  26.37 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  29.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  29.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  29.13 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  29.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  29.1 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  29.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  27.27 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  28.06 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  24.78 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  26.67 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  27.18 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  27.46 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  25.88 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  26.34 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  26.6 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  29.09 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  28.65 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  25.25 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  23.89 
 
 		 232 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  28.16 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  26.18 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  27.54 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  28.99 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  27.27 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>