150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1375 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1375  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.40169 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2534  reductase  63.41 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00461  putative reductase  62.65 
 
 		 174 aa  201  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00441  putative reductase  52.15 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00421  putative reductase  51.53 
 
 		 174 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2185  reductase  62.82 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0042  putative reductase  49.69 
 
 		 174 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00481  putative reductase  51.2 
 
 		 174 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28861  putative reductase  63.29 
 
 		 175 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00551  putative reductase  54.32 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1374  putative reductase  53.7 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.325485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  33.8 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  32.88 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  30 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  37.35 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  29.45 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  35.61 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  36.45 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  36.45 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2733  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0209  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  36.45 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  36.45 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  36.45 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  36.45 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  36.45 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  33.62 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  38.83 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  34.09 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  30.99 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  30.54 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2714  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  32.76 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  30.97 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 		 201 aa  50.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1389  hypothetical protein  27.86 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1216  NADPH-dependent FMN reductase  24.1 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.25 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1493  NADPH-dependent FMN reductase  29.85 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.247628 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  29.37 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0509  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0312157  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03109  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1020  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 		 197 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2378  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 192 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1887  NADPH-dependent FMN reductase  31.85 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0302  hypothetical protein  29.09 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5934  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0014  NADPH-dependent FMN reductase  28.32 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  27.03 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  27.03 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2655  NADPH-dependent FMN reductase  27.86 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0138  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.044565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2335  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3285  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  36.76 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  26.06 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3359  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2051  flavoprotein  29.73 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00942  hypothetical protein  34.52 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09863  hypothetical protein  25 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2763  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0421  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.152802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 184 aa  44.3  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17270  predicted flavoprotein  30 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>