244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1353 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 122 aa  254  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  86.07 
 
 		 122 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  84.43 
 
 		 122 aa  222  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  78.69 
 
 		 122 aa  209  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  78.69 
 
 		 122 aa  209  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  78.69 
 
 		 122 aa  209  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  77.05 
 
 		 122 aa  205  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  72.13 
 
 		 122 aa  193  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  63.93 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  56.9 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  53.45 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  54.31 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  53.45 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  52.59 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  50.86 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  54.7 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  52.14 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  45 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 341 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 313 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  32.14 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  31.53 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.43 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  33.33 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.25 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  32.08 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  32.08 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.21 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1875  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.46 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>