198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0921 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  68.72 
 
 
183 aa  245  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  61.31 
 
 
174 aa  203  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  59.3 
 
 
181 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  58.72 
 
 
181 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  58.72 
 
 
181 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  58.72 
 
 
181 aa  200  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  58.72 
 
 
173 aa  200  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  58.93 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  59.52 
 
 
174 aa  198  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  57.71 
 
 
176 aa  197  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  56.21 
 
 
177 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  58.43 
 
 
176 aa  191  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  50 
 
 
174 aa  151  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  40.35 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  41.56 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
177 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  40.77 
 
 
191 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  44.17 
 
 
188 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  43.33 
 
 
188 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  45.83 
 
 
190 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  36.5 
 
 
194 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  36.36 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  44.83 
 
 
205 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  35.66 
 
 
200 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  42.65 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  37.41 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  39.13 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  42.22 
 
 
199 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  40.77 
 
 
191 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
194 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  34.97 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  36.91 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  39.23 
 
 
195 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
200 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  41.8 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  43.09 
 
 
195 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
209 aa  91.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  37.27 
 
 
194 aa  91.3  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  36.3 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  37.31 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
207 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  31.29 
 
 
276 aa  88.6  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  37.93 
 
 
195 aa  87.4  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  39.5 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  40.48 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  40.48 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  38.21 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  32.58 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  33.56 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  34.23 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  34.44 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.77 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  28.74 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  30.92 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  30.92 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  31.74 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  31.9 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.68 
 
 
196 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  29.61 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  29.61 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  26.97 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  28.57 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 
202 aa  61.6  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  31.71 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
277 aa  58.2  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.62 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  28.07 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  29.46 
 
 
197 aa  52  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
218 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  30.36 
 
 
286 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
200 aa  50.8  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  28.06 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
208 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  25.9 
 
 
201 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  29.76 
 
 
286 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
221 aa  48.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  26.63 
 
 
198 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>