More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27.02 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 285 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 285 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  22.84 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  22.95 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  20.31 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.51 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  22.34 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.85 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.87 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.87 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  24.51 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  22.4 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.15 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  26.98 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  22.22 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.84 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.27 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  24.34 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  22.99 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  21.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  21.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  21.76 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.24 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  25.88 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.42 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 293 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  24.85 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  31.79 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  28.5 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  30.39 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  24.63 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  22.31 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.57 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  21.32 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  24.19 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  24.46 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  30.05 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>