129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3441  peptidase S45 penicillin amidase  54.99 
 
 
975 aa  988    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.830206  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  52.49 
 
 
1070 aa  972    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14090  penicilin amidase  100 
 
 
951 aa  1952    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  48.58 
 
 
1103 aa  947    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0600  Penicillin amidase  55.79 
 
 
970 aa  1046    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1853  Penicillin amidase  42.59 
 
 
926 aa  662    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.267516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  50.26 
 
 
1059 aa  939    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2701  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 
820 aa  267  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066786  decreased coverage  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  25.45 
 
 
833 aa  124  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  25.99 
 
 
803 aa  124  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  23.68 
 
 
825 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  24.66 
 
 
804 aa  108  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.88 
 
 
770 aa  106  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  22.09 
 
 
812 aa  101  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  25.04 
 
 
783 aa  95.9  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.21 
 
 
769 aa  95.1  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  23.04 
 
 
790 aa  93.2  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.12 
 
 
818 aa  92.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  21.99 
 
 
818 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  22.17 
 
 
795 aa  89  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  22.61 
 
 
795 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  23.97 
 
 
819 aa  87.4  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  23.09 
 
 
819 aa  86.3  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  22.63 
 
 
787 aa  84.7  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  20.96 
 
 
795 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  23.33 
 
 
789 aa  80.1  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  23.09 
 
 
844 aa  78.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  26.6 
 
 
774 aa  77  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  24.34 
 
 
829 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  23.29 
 
 
855 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  21.37 
 
 
803 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  23.59 
 
 
870 aa  71.2  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  25.56 
 
 
864 aa  71.2  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  26.09 
 
 
841 aa  68.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  26.3 
 
 
779 aa  68.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  23.45 
 
 
812 aa  67.8  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  22.41 
 
 
854 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  23.57 
 
 
854 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  24.48 
 
 
947 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  22.76 
 
 
947 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  22.54 
 
 
836 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  24.15 
 
 
963 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  30.98 
 
 
827 aa  63.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  23.36 
 
 
947 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  22.39 
 
 
806 aa  61.2  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.71 
 
 
796 aa  61.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  30.71 
 
 
796 aa  61.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  30.71 
 
 
796 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.71 
 
 
796 aa  61.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  22.6 
 
 
807 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.71 
 
 
796 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.71 
 
 
796 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  31.5 
 
 
796 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  26.86 
 
 
826 aa  60.1  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  24.05 
 
 
809 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  22.02 
 
 
827 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  22.98 
 
 
768 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  24.76 
 
 
821 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  23.9 
 
 
784 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30 
 
 
796 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  25 
 
 
872 aa  58.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  22.88 
 
 
857 aa  58.9  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  21.42 
 
 
807 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  21.69 
 
 
810 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  30.71 
 
 
796 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  23.26 
 
 
792 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  23.94 
 
 
787 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  22.67 
 
 
889 aa  58.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  39.78 
 
 
821 aa  58.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  23.12 
 
 
788 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  21.43 
 
 
795 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  23.2 
 
 
903 aa  57.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  23.94 
 
 
787 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  28.89 
 
 
821 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  29.13 
 
 
796 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  21.34 
 
 
808 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  38.54 
 
 
823 aa  55.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  29.55 
 
 
823 aa  55.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  29.55 
 
 
823 aa  55.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  23.59 
 
 
788 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  22.37 
 
 
809 aa  55.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  23.72 
 
 
809 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  24.6 
 
 
827 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  25.27 
 
 
829 aa  53.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  24.49 
 
 
785 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  23.06 
 
 
641 aa  52.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  31.97 
 
 
780 aa  52.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  34.15 
 
 
818 aa  52.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  21.15 
 
 
811 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  30.97 
 
 
782 aa  52  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3735  penicillin amidase  26.57 
 
 
758 aa  52  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  38.46 
 
 
774 aa  52  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  26.6 
 
 
813 aa  52  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  23.1 
 
 
760 aa  51.6  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  24.93 
 
 
792 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  23.88 
 
 
829 aa  51.2  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  23.4 
 
 
843 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  32.2 
 
 
837 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  32.2 
 
 
837 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  32.2 
 
 
837 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>