118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  100 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  41.21 
 
 		 283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  42.95 
 
 		 378 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  40.72 
 
 		 296 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  38.42 
 
 		 297 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  38.75 
 
 		 405 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  42.86 
 
 		 177 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  42.86 
 
 		 177 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  32.63 
 
 		 279 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  41.35 
 
 		 177 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  36.05 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  45.45 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  35.21 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  37.3 
 
 		 148 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3737  DoxX family protein  46.79 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  37.6 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  35.21 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.51 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  35.21 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  34.88 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  36.69 
 
 		 172 aa  62  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.6 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.65 
 
 		 149 aa  62  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  35.26 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.16 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.22 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  42.28 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  38.58 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  39.84 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.78 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  38.1 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  34.11 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.65 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  38.1 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  38.1 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  40.77 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  38.52 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  33.78 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1884  DoxX family protein  43.27 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0388995  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  33.86 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  33.33 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  36.92 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  35.56 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  30.83 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  38 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  38.3 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  36.27 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  33.59 
 
 		 154 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  40.16 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1904  DoxX  42.11 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1950  DoxX family protein  42.11 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.992503  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  32.5 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  35.61 
 
 		 147 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  32.81 
 
 		 143 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  37.12 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  38.81 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  36.72 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  36.72 
 
 		 173 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  36.72 
 
 		 173 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  36.72 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  34.13 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  36.72 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  34.46 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  36.43 
 
 		 144 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.26 
 
 		 134 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  35.11 
 
 		 148 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.15 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  38.76 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  33.83 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  33.83 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  35.29 
 
 		 144 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  34.81 
 
 		 134 aa  48.5  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  27.78 
 
 		 175 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  38.58 
 
 		 144 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.31 
 
 		 147 aa  48.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  33.83 
 
 		 181 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  35.56 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  35.61 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  37.7 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  37.7 
 
 		 147 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  34.81 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  32.88 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  37.7 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  33.09 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  39.52 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  35.17 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  36.89 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.43 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  38.71 
 
 		 150 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  37.1 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  30.13 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  30.09 
 
 		 144 aa  45.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3171  DoxX family protein  41.98 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  34.43 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  34.96 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1741  DoxX family protein  35.14 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  32.06 
 
 		 134 aa  45.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  38.58 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  28.36 
 
 		 128 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>