195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 290 aa  567  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0931  Methyltransferase type 12  51.02 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2858  methyltransferase type 12  45.28 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0914864  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5374  hypothetical protein  38.62 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4196  Methyltransferase type 12  37.25 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  decreased coverage  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  37.59 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2993  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  31.08 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.67 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.48 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.15 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  31.86 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  32.58 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  31.2 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.94 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  31.06 
 
 		 395 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35 
 
 		 402 aa  53.1  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  25.98 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.04 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  24 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  31.2 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5795  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  34.26 
 
 		 414 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 390 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.74 
 
 		 244 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 202 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.4 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  31.38 
 
 		 407 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 191 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 187 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  32.11 
 
 		 344 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  31.58 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 402 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.62 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08910  polyketide synthase, putative (JCVI)  30.09 
 
 		 2449 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  30.97 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  25.18 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  28.18 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.77 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  23.72 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  26.56 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  29.66 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  25.36 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.91 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 440 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  33.03 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  30.26 
 
 		 907 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06431  polyketide synthase, putative (JCVI)  30.51 
 
 		 2410 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.572947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  30.84 
 
 		 400 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  26.9 
 
 		 204 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  29.63 
 
 		 392 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 246 aa  45.8  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  25.23 
 
 		 524 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.33 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.33 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  26.36 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.33 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.85 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>