More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 330 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  58.71 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  43.52 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 		 423 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  44.76 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  37.15 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  41.86 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  39.48 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.87 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  39.03 
 
 		 362 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  38.56 
 
 		 373 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  40.76 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  39.38 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.44 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  39.51 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  41.33 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  38.22 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.66 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  40.73 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  45.55 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  35.08 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  33.93 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 265 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  32.43 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  30 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.25 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.21 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.9 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.54 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.59 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  28.03 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.39 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.76 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.74 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.24 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.82 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  25.23 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.13 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  27.74 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.1 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  24.82 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>