More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4530 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 		 152 aa  297  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  98.03 
 
 		 152 aa  291  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  63.27 
 
 		 162 aa  189  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  60.4 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  63.76 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  62.76 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  58.55 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  58.94 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  59.29 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  58.45 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  52.11 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  54.29 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  51.39 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  45.65 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  45.26 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.23 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 170 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 168 aa  84  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 159 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.13 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 166 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  35.66 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  35.37 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  34.9 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.72 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  30.25 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  30.25 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>