More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4473 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4473  transketolase, central region  100 
 
 		 296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0113424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4986  transketolase central region  89.53 
 
 		 296 aa  474  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.545662  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  62.42 
 
 		 307 aa  342  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  57.09 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  58.22 
 
 		 296 aa  291  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1273  transketolase central region  53.06 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.257757  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  35.26 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  35.9 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  30.64 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  30.64 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  32.69 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  27.78 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  37.34 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  21.4 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  30.03 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  30.63 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  25.19 
 
 		 304 aa  85.5  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  22.4 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0180  transketolase, central region  30.66 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  25.95 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  26 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  30.42 
 
 		 592 aa  80.5  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  32.9 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  29.28 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0983  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  32.2 
 
 		 624 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1764  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.14 
 
 		 626 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  32.05 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  27.41 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  22.95 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  30.95 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  27.65 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  30.08 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.48 
 
 		 640 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3844  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.7 
 
 		 631 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  22.3 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  34.81 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  39.34 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1963  transketolase, C-terminal subunit  35.54 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.686485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  35.44 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  30.36 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  28.88 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1058  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.41 
 
 		 608 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  29.69 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  35.25 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  26.99 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  35.25 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1679  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.33 
 
 		 643 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  22.26 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  27.18 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2438  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.46 
 
 		 643 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  24.26 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  31.62 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  25.57 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.17 
 
 		 625 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1057  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.19 
 
 		 627 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1097  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.03 
 
 		 636 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.124796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  25.33 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  27.12 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1157  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.33 
 
 		 636 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  27.6 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0671  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.48 
 
 		 643 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  26.92 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2604  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  27.3 
 
 		 618 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  23.13 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0450  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.48 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  35.35 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  29.3 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  35.29 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  35.35 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  35.35 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  35.35 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0817  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.1 
 
 		 639 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.64849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  28.46 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  34.31 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  25.96 
 
 		 635 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  35.2 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004258  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase  26.45 
 
 		 621 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1826  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.3 
 
 		 659 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2615  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.82 
 
 		 637 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207867  normal  0.922526 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0905  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.74 
 
 		 617 aa  69.3  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01171  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.2 
 
 		 638 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.994289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1225  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  32.37 
 
 		 636 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3648  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.23 
 
 		 634 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1628  transketolase, C-terminal subunit  33.06 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  30.13 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2655  transketolase, C-terminal subunit  33.06 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2568  transketolase domain-containing protein  33.06 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1404  transketolase, C-terminal subunit  33.06 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2515  transketolase domain-containing protein  33.06 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4486  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.23 
 
 		 646 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1054  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.94 
 
 		 608 aa  68.9  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  24.22 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3879  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.23 
 
 		 646 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2130  transketolase, C-terminal subunit  33.06 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.963697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3184  transketolase, C-terminal subunit  33.06 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  26.95 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  36.17 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  29.7 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1398  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.12 
 
 		 629 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3362  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.04 
 
 		 635 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>