More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4274 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 299 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  88.59 
 
 		 299 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  59.45 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  61.94 
 
 		 291 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  60.21 
 
 		 300 aa  332  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  61.59 
 
 		 303 aa  331  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  62.32 
 
 		 320 aa  328  7e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  60.21 
 
 		 296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  59.57 
 
 		 293 aa  324  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  61.79 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  57.54 
 
 		 329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  58.93 
 
 		 288 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  59.57 
 
 		 287 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  61.35 
 
 		 290 aa  316  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  60.28 
 
 		 288 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  60.28 
 
 		 288 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  60.28 
 
 		 288 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  57.8 
 
 		 291 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  59.57 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  61.05 
 
 		 300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  57.19 
 
 		 303 aa  305  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  61.27 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  55.56 
 
 		 300 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  56.38 
 
 		 304 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  54.09 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  53.49 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  52.2 
 
 		 313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  57.2 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  55.07 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  53.08 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  52.86 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  54.84 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  53.33 
 
 		 285 aa  258  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  55 
 
 		 285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  53.74 
 
 		 581 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  42.06 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.13 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  40.77 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  44 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  39.29 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  45.52 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  39.93 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.3 
 
 		 348 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  43.33 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.94 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  38.22 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.77 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.77 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  40.59 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  37.65 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  37.71 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  39.46 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.33 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  44.65 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.02 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  38.33 
 
 		 401 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  38.6 
 
 		 365 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  40.6 
 
 		 383 aa  148  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  39.64 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  38.43 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  38.53 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  41.78 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.25 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 363 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  43.35 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  38.03 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 368 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  39.22 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  40.09 
 
 		 368 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 368 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 368 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  37.67 
 
 		 388 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 362 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  37.66 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.58 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.76 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  41.55 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  35.18 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  36.36 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  36.8 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  36.8 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  36.36 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  36.8 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.01 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  36.8 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.5 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  39.19 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  38.37 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  36.8 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>