More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3544 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  95.16 
 
 		 867 aa  1626    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  62.95 
 
 		 867 aa  1099    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  49.7 
 
 		 786 aa  754    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  60.33 
 
 		 842 aa  1003    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  51.53 
 
 		 876 aa  815    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  100 
 
 		 867 aa  1740    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  58.3 
 
 		 847 aa  968    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  51.11 
 
 		 893 aa  821    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  59.46 
 
 		 844 aa  996    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  37.77 
 
 		 610 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  37.77 
 
 		 610 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  37.77 
 
 		 610 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  37.77 
 
 		 610 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  37.77 
 
 		 610 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  37.77 
 
 		 610 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  37.77 
 
 		 610 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  37.27 
 
 		 611 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  36.78 
 
 		 609 aa  343  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  36.38 
 
 		 598 aa  342  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  37.11 
 
 		 609 aa  342  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  36.95 
 
 		 609 aa  341  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  37.58 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  36.29 
 
 		 594 aa  336  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  36.95 
 
 		 665 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  36.62 
 
 		 609 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  36.62 
 
 		 609 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  35.31 
 
 		 627 aa  333  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  36.45 
 
 		 609 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  36.47 
 
 		 586 aa  331  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  34.95 
 
 		 612 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  35.4 
 
 		 605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  36.59 
 
 		 600 aa  325  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  35.52 
 
 		 596 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  35.04 
 
 		 613 aa  324  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  34.55 
 
 		 601 aa  324  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  34.75 
 
 		 619 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  34.59 
 
 		 619 aa  321  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  35.14 
 
 		 620 aa  321  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  34.19 
 
 		 629 aa  320  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  34.11 
 
 		 869 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  33.98 
 
 		 613 aa  319  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  35.56 
 
 		 602 aa  318  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  35.27 
 
 		 639 aa  317  9e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  34.43 
 
 		 625 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  34.82 
 
 		 614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.45 
 
 		 601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 617 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.94 
 
 		 597 aa  315  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  35.59 
 
 		 605 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  34.94 
 
 		 628 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  35.5 
 
 		 610 aa  313  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  34.38 
 
 		 608 aa  313  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  35.85 
 
 		 595 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  33.98 
 
 		 629 aa  310  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  35.32 
 
 		 596 aa  310  9e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  32.69 
 
 		 606 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 		 612 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  35.22 
 
 		 619 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  31.84 
 
 		 894 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 627 aa  309  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  35.34 
 
 		 868 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  35.29 
 
 		 616 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  34.43 
 
 		 626 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 		 598 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  34.95 
 
 		 605 aa  307  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  34.84 
 
 		 602 aa  307  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  34.84 
 
 		 602 aa  306  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  35.46 
 
 		 600 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  34.09 
 
 		 623 aa  306  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  36.36 
 
 		 602 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  35.45 
 
 		 601 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 		 626 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  36.03 
 
 		 602 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  34.84 
 
 		 602 aa  303  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  32.96 
 
 		 623 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 		 626 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  34.68 
 
 		 597 aa  300  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  34.95 
 
 		 629 aa  300  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  31.95 
 
 		 617 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  35.25 
 
 		 589 aa  300  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 		 598 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  35.66 
 
 		 600 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4874  glycoside hydrolase 15-related  35.55 
 
 		 598 aa  298  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0766872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  32.31 
 
 		 609 aa  297  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  32.57 
 
 		 642 aa  297  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  34.16 
 
 		 603 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  33.99 
 
 		 599 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  34.28 
 
 		 601 aa  295  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  34.44 
 
 		 611 aa  294  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  34.96 
 
 		 621 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  34.09 
 
 		 594 aa  294  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  33.97 
 
 		 627 aa  293  8e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  35.02 
 
 		 629 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  32.33 
 
 		 619 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  31.59 
 
 		 668 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  34.02 
 
 		 645 aa  289  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  34.31 
 
 		 617 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  34.32 
 
 		 599 aa  289  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  34.25 
 
 		 617 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  31.42 
 
 		 677 aa  287  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>