More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3181 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  64.92 
 
 		 609 aa  709    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  61.63 
 
 		 608 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  58.4 
 
 		 613 aa  641    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  61.51 
 
 		 602 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  90.08 
 
 		 625 aa  1057    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  100 
 
 		 625 aa  1199    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  61.49 
 
 		 591 aa  624  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  55.79 
 
 		 671 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  55.41 
 
 		 726 aa  611  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  55.44 
 
 		 589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  57.21 
 
 		 597 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.17 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.25 
 
 		 617 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  53.3 
 
 		 610 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  51.48 
 
 		 635 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.98 
 
 		 730 aa  465  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 605 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  50.84 
 
 		 608 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.24 
 
 		 606 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  43.49 
 
 		 584 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.27 
 
 		 984 aa  297  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.65 
 
 		 627 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.44 
 
 		 614 aa  272  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.14 
 
 		 1284 aa  270  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.51 
 
 		 622 aa  267  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  39.2 
 
 		 654 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 628 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  29.67 
 
 		 594 aa  265  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 622 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 571 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  36.39 
 
 		 659 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.81 
 
 		 571 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 571 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.19 
 
 		 641 aa  264  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.81 
 
 		 571 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.81 
 
 		 571 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 		 571 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  37.5 
 
 		 627 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.64 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  42.45 
 
 		 1231 aa  262  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.46 
 
 		 571 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  35.36 
 
 		 638 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 		 571 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.64 
 
 		 571 aa  259  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.68 
 
 		 588 aa  259  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.29 
 
 		 587 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.31 
 
 		 636 aa  259  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  37.63 
 
 		 663 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  35.23 
 
 		 636 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  35.27 
 
 		 638 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  35.98 
 
 		 620 aa  258  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.14 
 
 		 1522 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.22 
 
 		 579 aa  257  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 640 aa  256  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  30.73 
 
 		 591 aa  256  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.73 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 575 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.62 
 
 		 1257 aa  254  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 		 604 aa  253  7e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.93 
 
 		 585 aa  253  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  35.3 
 
 		 631 aa  252  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.15 
 
 		 602 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  37.94 
 
 		 631 aa  251  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  35.36 
 
 		 626 aa  250  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.35 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.91 
 
 		 650 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.91 
 
 		 650 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  30.08 
 
 		 585 aa  249  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  32.24 
 
 		 576 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 632 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.29 
 
 		 598 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 578 aa  249  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  35.3 
 
 		 627 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  29.13 
 
 		 588 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  34.01 
 
 		 596 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  35.3 
 
 		 627 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.86 
 
 		 641 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  29.64 
 
 		 583 aa  247  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  37.02 
 
 		 577 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.51 
 
 		 589 aa  246  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.93 
 
 		 601 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.92 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 636 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.06 
 
 		 597 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.14 
 
 		 572 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  31.97 
 
 		 604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  35.5 
 
 		 642 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.9 
 
 		 573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.6 
 
 		 586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.31 
 
 		 606 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.05 
 
 		 593 aa  244  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.68 
 
 		 572 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  31.5 
 
 		 586 aa  243  6e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  36.78 
 
 		 612 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  35 
 
 		 640 aa  243  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  28.74 
 
 		 589 aa  243  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  32.48 
 
 		 649 aa  242  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  32 
 
 		 639 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  30.5 
 
 		 572 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>