126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1647 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  698    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  84.03 
 
 		 338 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  52.35 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  50.84 
 
 		 266 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  64.88 
 
 		 244 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  43.43 
 
 		 262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  59.65 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  56.73 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  58.5 
 
 		 183 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  55.84 
 
 		 172 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  52.35 
 
 		 171 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  46.19 
 
 		 651 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  45.24 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  40.61 
 
 		 197 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  42.78 
 
 		 201 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  40.76 
 
 		 201 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  33.94 
 
 		 456 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  37.95 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  38.46 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  39.77 
 
 		 221 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  37.95 
 
 		 221 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  38.97 
 
 		 221 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  38.97 
 
 		 221 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  38.97 
 
 		 221 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.02 
 
 		 481 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  37.95 
 
 		 221 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  38.97 
 
 		 221 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.02 
 
 		 481 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  39.2 
 
 		 221 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 216 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 458 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.02 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  36.04 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.02 
 
 		 481 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.91 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  31.91 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  34.22 
 
 		 459 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  36 
 
 		 491 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  32.07 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  33.77 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.41 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  35.64 
 
 		 197 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  32.09 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  32.09 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.05 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  32.7 
 
 		 220 aa  102  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.33 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.33 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.87 
 
 		 491 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.75 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  32.29 
 
 		 455 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  32.29 
 
 		 455 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.65 
 
 		 471 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  28.89 
 
 		 445 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  37.71 
 
 		 458 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  30.18 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.16 
 
 		 486 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.86 
 
 		 487 aa  92.8  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.62 
 
 		 491 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  33.86 
 
 		 487 aa  86.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.54 
 
 		 497 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.63 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.02 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  63.64 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  30.54 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  61.36 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  58.33 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03626  hypothetical protein  36.26 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  27.24 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002434  deacetylase DA1  35.87 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  71.43 
 
 		 1077 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  42.5 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0899  hypothetical protein  32.97 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  33.17 
 
 		 904 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  27.75 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  52.83 
 
 		 551 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  25.85 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.62 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  50.91 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0564  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 424 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  53.33 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  63.41 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  41.57 
 
 		 652 aa  56.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  35.95 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  50 
 
 		 855 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 192 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  39.09 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  26.67 
 
 		 236 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  46.6 
 
 		 543 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  40.79 
 
 		 682 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  44.74 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  50 
 
 		 605 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  26.24 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  45.33 
 
 		 258 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  51.81 
 
 		 830 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  34.26 
 
 		 451 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  34.26 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  34.26 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>