More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0598 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1951 aa  3805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.4 
 
 		 1984 aa  966    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  37.75 
 
 		 1908 aa  1050    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  40.75 
 
 		 1934 aa  1035    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  38.27 
 
 		 1929 aa  1004    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  39.53 
 
 		 1935 aa  1031    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2179  Beta-ketoacyl synthase  39.15 
 
 		 1927 aa  909    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0632435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  37.53 
 
 		 1985 aa  965    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  38.1 
 
 		 1923 aa  1003    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  39.3 
 
 		 2888 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8249  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  47.22 
 
 		 1501 aa  444  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  33.52 
 
 		 2298 aa  354  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  30.66 
 
 		 2772 aa  348  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.25 
 
 		 2477 aa  348  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  30.96 
 
 		 1272 aa  346  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  33.72 
 
 		 2503 aa  347  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  33.05 
 
 		 2553 aa  345  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.08 
 
 		 2443 aa  335  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  34.19 
 
 		 2314 aa  333  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  31.32 
 
 		 2189 aa  331  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.68 
 
 		 1772 aa  327  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  30.21 
 
 		 2664 aa  326  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  30.03 
 
 		 2703 aa  325  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  30.3 
 
 		 3243 aa  325  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  30.19 
 
 		 3115 aa  324  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32 
 
 		 2249 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  30.07 
 
 		 2764 aa  322  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  30.28 
 
 		 2620 aa  322  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.03 
 
 		 2694 aa  320  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  34.55 
 
 		 2386 aa  320  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.81 
 
 		 2750 aa  320  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  29.42 
 
 		 2683 aa  319  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  29.85 
 
 		 2693 aa  319  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.68 
 
 		 2704 aa  319  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  30.02 
 
 		 2642 aa  319  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.64 
 
 		 2414 aa  318  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 		 2560 aa  316  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  28.89 
 
 		 2300 aa  315  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  30.16 
 
 		 2531 aa  315  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  30.29 
 
 		 2619 aa  315  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  30.68 
 
 		 2657 aa  314  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  33.16 
 
 		 2628 aa  314  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33 
 
 		 2674 aa  313  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  29.89 
 
 		 1764 aa  312  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  30.56 
 
 		 2624 aa  312  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.85 
 
 		 2661 aa  310  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  29.81 
 
 		 2542 aa  308  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  30.1 
 
 		 2327 aa  307  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.7 
 
 		 2771 aa  305  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  33.37 
 
 		 2266 aa  302  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  29.42 
 
 		 2640 aa  301  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  31.19 
 
 		 2448 aa  301  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.83 
 
 		 3099 aa  300  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  25.94 
 
 		 2754 aa  297  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  34.48 
 
 		 3008 aa  288  5.999999999999999e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  33.55 
 
 		 2816 aa  287  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.8 
 
 		 1845 aa  287  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  26.61 
 
 		 2551 aa  286  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  30.3 
 
 		 3252 aa  286  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.59 
 
 		 1656 aa  285  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  30.05 
 
 		 1413 aa  284  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  28.89 
 
 		 1587 aa  281  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  31.48 
 
 		 1828 aa  274  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.97 
 
 		 2260 aa  274  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  32.3 
 
 		 7279 aa  273  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  27.77 
 
 		 1354 aa  271  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  26.36 
 
 		 1087 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 		 1874 aa  269  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.44 
 
 		 3696 aa  269  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  30.64 
 
 		 1402 aa  267  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  33.74 
 
 		 3424 aa  265  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 2551 aa  264  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  29.88 
 
 		 1939 aa  262  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 1453 aa  262  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  31.77 
 
 		 2498 aa  261  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 		 2985 aa  261  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 2374 aa  260  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  27.68 
 
 		 1559 aa  260  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  30.81 
 
 		 3676 aa  260  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  31.84 
 
 		 1631 aa  259  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6222  beta-ketoacyl synthase  30.32 
 
 		 1304 aa  259  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  32.57 
 
 		 2376 aa  259  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  30.48 
 
 		 4101 aa  259  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  30.95 
 
 		 3693 aa  258  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  30.95 
 
 		 3693 aa  258  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  27.46 
 
 		 1559 aa  257  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  27.57 
 
 		 2462 aa  257  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  30.06 
 
 		 2150 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  31.1 
 
 		 1480 aa  255  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  29.87 
 
 		 1470 aa  254  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  30.37 
 
 		 3702 aa  254  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  30.18 
 
 		 1489 aa  254  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  30.84 
 
 		 3176 aa  254  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  26.76 
 
 		 1408 aa  253  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  34.24 
 
 		 3148 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  32.72 
 
 		 1740 aa  253  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  32.14 
 
 		 2943 aa  253  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  31.1 
 
 		 3645 aa  252  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  27.46 
 
 		 1833 aa  252  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  30.55 
 
 		 2684 aa  252  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>