More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1663 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  100 
 
 
436 aa  903    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  75.17 
 
 
445 aa  670    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  82.68 
 
 
443 aa  748    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  65.98 
 
 
460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  64.06 
 
 
403 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  64.06 
 
 
403 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  64.06 
 
 
403 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  64.29 
 
 
403 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  64.06 
 
 
402 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  64.06 
 
 
403 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  64.06 
 
 
403 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  64.06 
 
 
403 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  62.07 
 
 
413 aa  549  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  59.4 
 
 
400 aa  538  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  43.22 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  39.86 
 
 
401 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  31.31 
 
 
394 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  28.28 
 
 
394 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  29.54 
 
 
394 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  28 
 
 
394 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  26.67 
 
 
402 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  27.8 
 
 
386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  27.76 
 
 
395 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.5 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  23.04 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  22.82 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  23.27 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  23.27 
 
 
422 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  22.6 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  22.89 
 
 
422 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  23.11 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  22.47 
 
 
422 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  22.47 
 
 
422 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  22.47 
 
 
422 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  22.47 
 
 
422 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.21 
 
 
385 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.41 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.41 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.1 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.77 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.26 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.02 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.58 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.85 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  24.44 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  24.19 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.84 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.23 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  23.79 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.05 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  23.9 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  21.8 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  24.37 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.49 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  24.49 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  25.43 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.43 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  25.43 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  25.43 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  24.25 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  25.43 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.89 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  25.19 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.38 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  25.31 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  23.6 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  21.65 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  25.43 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  23.69 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  23.31 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  34.93 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  23.89 
 
 
376 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.63 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.56 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  23.96 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.29 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  24.26 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  24.2 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  24.19 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  23.36 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  23.72 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.24 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  23.42 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.08 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  23.97 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  29.63 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.83 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  23.59 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.15 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  23.18 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.68 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  23.64 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  23.86 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.29 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  24.74 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30.14 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>