59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1755 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  100 
 
 		 469 aa  911    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  71.91 
 
 		 463 aa  659    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  37.89 
 
 		 476 aa  316  7e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  37.26 
 
 		 476 aa  292  8e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  36.61 
 
 		 465 aa  266  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  34.66 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  37.05 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  34.95 
 
 		 459 aa  249  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  36.98 
 
 		 482 aa  243  6e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  33.05 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  33.48 
 
 		 478 aa  233  7.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  33.33 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  30.35 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  31.79 
 
 		 559 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  30.2 
 
 		 477 aa  227  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  29.33 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  30.08 
 
 		 492 aa  220  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  31.04 
 
 		 477 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  31.93 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  31.42 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  31.69 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  31.57 
 
 		 478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  30.58 
 
 		 599 aa  212  9e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  28.74 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  31.3 
 
 		 442 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  30.67 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  29.31 
 
 		 492 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  28.19 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  28.86 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  28.6 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  27.18 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  26.4 
 
 		 500 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  31.45 
 
 		 537 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  27.14 
 
 		 501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  22.88 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  23.57 
 
 		 437 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  24.75 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  24.89 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  23.55 
 
 		 437 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  24.34 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.43 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  23.64 
 
 		 437 aa  50.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  24.1 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  23.29 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  24.08 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  24.47 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  24.76 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  27.33 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  22.14 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  22.66 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  22.7 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  23.15 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  22.28 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.43 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  23.34 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  24.48 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  23.18 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  23.42 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1847  preprotein translocase subunit SecY  21.14 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>