More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1847 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1847  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 441 aa  858    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  53.24 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  51.79 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  46.99 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  45.48 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  45.07 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  44.77 
 
 		 431 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.34 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  43.08 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.47 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.7 
 
 		 435 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.68 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.34 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  43.09 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 		 430 aa  346  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  42.63 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  43.75 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  42.51 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  45.22 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  43.27 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 429 aa  338  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  45.14 
 
 		 419 aa  338  9e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  42.12 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  42.96 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  43.71 
 
 		 441 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  44.88 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  43.47 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  43.49 
 
 		 441 aa  335  9e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  42.67 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  44.88 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.09 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  43.23 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  41.24 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  42.83 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  43.18 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  40.92 
 
 		 422 aa  329  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  43.08 
 
 		 428 aa  328  9e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  41.46 
 
 		 430 aa  328  9e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.3 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.74 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.73 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  41.5 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.17 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  42.22 
 
 		 500 aa  325  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  43.27 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  43.67 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  41.52 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  43.95 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  41.8 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  41.85 
 
 		 445 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 		 446 aa  322  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.96 
 
 		 419 aa  322  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  42.41 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  44.37 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  41.34 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  41.08 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  40.73 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  42.45 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  42.57 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  41.08 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  41 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  40.6 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  39.31 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.72 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 		 446 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  40.6 
 
 		 446 aa  319  7.999999999999999e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  42.64 
 
 		 457 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  41.23 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  40.6 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  39.08 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  42.31 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 		 443 aa  316  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  40.81 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  41.53 
 
 		 430 aa  316  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  42.38 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  42.48 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 		 454 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.08 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  40.92 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  40.45 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.49 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  39.64 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>