More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1144 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1144  ABC transporter related protein  100 
 
 
373 aa  746    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.814209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0179  ABC transporter related  56.68 
 
 
367 aa  421  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.732019  normal  0.13426 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.91 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  27.74 
 
 
474 aa  139  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  26.97 
 
 
495 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  26.77 
 
 
501 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  25.74 
 
 
484 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  27.73 
 
 
482 aa  133  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  25.98 
 
 
482 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  26.42 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  25.98 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  28.12 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  25.53 
 
 
491 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  25.97 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  24.56 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  26.05 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  23.57 
 
 
498 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  24.72 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  26.65 
 
 
467 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.34 
 
 
491 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.06 
 
 
473 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  26.82 
 
 
408 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  25.81 
 
 
530 aa  123  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.35 
 
 
479 aa  122  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  26.3 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  26.79 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  24.9 
 
 
541 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  26.49 
 
 
492 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
502 aa  118  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  26.19 
 
 
477 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  25.38 
 
 
491 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.32 
 
 
770 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  23.44 
 
 
481 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  28.38 
 
 
463 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.21 
 
 
481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  27.84 
 
 
574 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  25.06 
 
 
528 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.17 
 
 
489 aa  116  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  24.6 
 
 
470 aa  115  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  26.43 
 
 
488 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  26.43 
 
 
488 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  23.57 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  26.08 
 
 
493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  25.4 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 
491 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  26.08 
 
 
474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  22.41 
 
 
531 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  26.43 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.29 
 
 
1091 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  25.38 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.94 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  25.11 
 
 
514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  23.28 
 
 
535 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  24 
 
 
541 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.95 
 
 
562 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  25.22 
 
 
466 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  25.22 
 
 
466 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.92 
 
 
568 aa  109  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  25.34 
 
 
475 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  24.41 
 
 
497 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  24.2 
 
 
568 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  24.45 
 
 
497 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  24.54 
 
 
469 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  23.06 
 
 
574 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  22.83 
 
 
568 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.17 
 
 
502 aa  106  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  23.97 
 
 
471 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.21 
 
 
566 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  24.16 
 
 
566 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  23.76 
 
 
566 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  25.73 
 
 
475 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  23.39 
 
 
509 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  23.43 
 
 
526 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  25.2 
 
 
566 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  23.55 
 
 
566 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  23.35 
 
 
566 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  26.52 
 
 
451 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  26.07 
 
 
490 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  23.55 
 
 
566 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  24.38 
 
 
534 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  23.01 
 
 
571 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  24.3 
 
 
516 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  23.12 
 
 
566 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  23.55 
 
 
566 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  22.67 
 
 
569 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  24.48 
 
 
558 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  23.2 
 
 
764 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  25.68 
 
 
494 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  23.09 
 
 
579 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  22.97 
 
 
454 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  24.29 
 
 
478 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  23.35 
 
 
566 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  23.7 
 
 
455 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  23.66 
 
 
517 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.38 
 
 
573 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  25.3 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  21.7 
 
 
581 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  24.53 
 
 
811 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  23.6 
 
 
576 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.67 
 
 
558 aa  91.3  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>